Transfuzja krwi nie zawsze jest przeciwwskazaniem do wykonania testu NIPT. Ważny jest m.in. rodzaj wykonanie transfuzji oraz czas jaki upłynął od jej przeprowadzenia. W zależności od producenta testu NIPT ograniczenia co do jego przeprowadzenia w związku z transfuzją krwi nieco się różnią, dlatego każdy przypadek należy skonsultować z lekarzem i laboratorium, które przeprowadzania badanie NIPT.