W odniesieniu do polskich warunków nieinwazyjne testy prenatalne są etyczne, jako że z jednej strony są bezpieczne dla płodu, a z drugiej nie rozpoznają choroby, jedynie oceniają jej ryzyko. Nieprawidłowy wynik nieinwazyjnych badań prenatalnych wymaga potwierdzenia badaniami inwazyjnymi – np amniopunkcją genetyczną. 

Nieco inaczej sytuacja może wyglądać w niektórych krajach, gdzie np jeden rodzaj płci może być preferowany i testy pozwalając na bardzo wczesne rozpoznanie płci mogą skłaniać przyszłych rodziców do podejmowania działań mających zakończyć ciążę z przyczyn pozamedycznych jedynie dlatego, że płeć dziecka jest dla nich niepożądana.