Zdarza się, że nie uda się uzyskać wyniku testu NIPT ( np. NiftyPro, NeoBona, Sanco, Harmony) z pobranej krwi. Najczęściej jest to spowodowane zbyt małą ilością wolnego pozakomórkowego DNA płodu, tj. cffDNA (cell free fetal DNA) we krwi kobiety ciężarnej. W takiej sytuacji wykonanie prawidłowej analizy nie jest możliwe i należy ponownie pobrać próbkę krwi za ok. 2 tygodnie.