Uważa się, że niektóre leki mogą mieć wpływ na wyniki badania NIPT, chociaż jak do tej pory ilość dostępnych na ten temat informacji jest niewielka. Lekiem, który może utrudnić bądź uniemożliwić wykonanie badania NIPT jest heparyna drobnocząsteczkowa (LMWH, ang. low molecular weight heparin).

Ponadto terapie interferonem, immunoglobuliną, ludzką albuminą surowicy czy też egzogennym DNA mogą wpływać na ilość i jakość krążącego w surowicy cfDNA. Dlatego też niektórzy producenci wymieniają je jako ograniczenia do przeprowadzenia testu NIPT, szczególnie jeżeli kobieta ciężarna jest w trakcie terapii lub upłynął krótki czas od jej zakończenia. W każdym takim przypadku należy skonsultować się z lekarzem i laboratorium wykonującym analizy. Przeciwwskazaniem do wykonania badania NIPT może być również terapia komórkami macierzystymi, szczególnie w przypadku testów NIPT wykorzystujących technikę SNP (polimorfizm pojedynczego nukleotydu (ang. single nucleotide polymorphism). W takim przypadku można wybrać inny typ testu NIPT oraz dodatkowo potwierdzić możliwość jego wykonania w laboratorium.

O przebiegu badania przeczytasz w artykule PRZEBIEG BADANIA NIPT.