Zespół Edwardsa, podobnie jak zespół Downa można wykryć już na etapie ciąży lub po urodzeniu dziecka. Badaniem, które umożliwia postawienie diagnozy jest genetyczne badanie kariotypu.

W praktyce wygląda to tak, że w pierwszym trymestrze ciąży wykonywane są nieinwazyjne badania prenatalne, jak USG prenatalne (11-13 tydzień ciąży), test PAPP-A (11-14 tydzień ciąży) czy testy typu NIPT (od 9-10 tygodnia ciąży). Są to badania przesiewowe, dzięki którym wiemy jakie jest ryzyko obciążenia płodu chorobą genetyczną.

Nieprawidłowe wyniki tych badań powinny zostać zweryfikowane badaniem diagnostycznym. W tym celu wykonuje się badania inwazyjne jak np. amniopunkcja genetyczna, podczas której możliwe jest pobranie materiału genetycznego płodu do badania kariotypu. Zdarza się, że rodzice nie zgadzają się  na wykonanie inwazyjnych procedur podczas ciąży. W takiej sytuacji badanie kariotypu jest wykonywane po urodzeniu, kiedy można już pobrać dziecku krew do badania.