Na początku wizyty lekarz przeprowadza wywiad, pyta m.in. o datę ostatniej miesiączki i dolegliwości z którymi pacjentka się zgłasza.

Kolejność badanych elementów nie ma znaczenia. W praktyce najczęściej lekarz zaczyna od identyfikacji pęcherza moczowego, następnie lokalizuje i ocenia szyjkę macicy, kanał szyjki macicy, zagłębienie odbytniczo-maciczne, macicę, endometrium, jeden  jajnik i przydatki, a na koniec drugi jajnik i przydatki. Narządy oceniane są w różnych płaszczyznach. USG ginekologiczne ocenia również wszystkie potencjalne zmiany patologiczne pod kątem ich kształtu, echogeniczności, rozmiaru oraz przepływu naczyniowego, aby ocenić je pod kątem potencjalnej złośliwości.

Badanie nie powinno sprawiać bólu, jest bezinwazyjne, jednak niektóre pacjentki odczuwają niewielki dyskomfort.