Jedzenie z mikrofali i kwestia jego bezpieczeństwa są tematem wielu kontrowersji. Dość często można się spotkać z opinią, że jest ono niezdrowe, a nawet szkodliwe dla zdrowia. Tymczasem, badania pokazują, że podgrzewanie w mikrofali nie zmienia wartości odżywczej żywności, ani nie powoduje żadnych niebezpiecznych zmian, które powodowałyby, że stanowiłoby one jakiekolwiek ryzyko. Dlatego kobiety w ciąży mogą bez obaw spożywać żywności z mikrofali.

Podgrzewanie w mikrofalówce pozwala na zachowanie większej ilości witamin i składników mineralnych niż w przypadku innej obróbki termicznej. Niektóre wyniki badań pokazują, że ten rodzaj obróbki pozwala na zachowanie prawie 100% kwasu foliowego w zielonych warzywa oraz zwiększa przyswajalność karotenoidów w pomidorach i marchwi oraz biotyny w jajkach. Nie powoduje też powstawania szkodliwych nitrozamin w mięsie, jak dzieje się to w przypadku ponownego odsmażania. To niewątpliwe zalety dla kobiet ciężarnych.
Jedyne zagrożenie płynące z jedzenia mikrofali wynikają z podgrzewania go w nieodpowiednich naczyniach. Bardzo ważne jest, aby sprawdzać oznaczenia na opakowaniach i wybierać wyłącznie te oznaczone symbolem kuchenki mikrofalowej. Jest to gwarancją tego, że podczas podgrzewania z opakowania do żywności nie przedostaną się żadne szkodliwe substancje.